La Subdirección Académica de la Universidad Francisco de Paula Santander Ocaña, es un organismo de gobierno; dependencia adscrita a la Dirección de la Seccional encargada de las funciones de orientación, planeación, organización y supervisión de las actividades docentes, investigativas y de extensión de la Universidad Francisco de Paula Santander, Seccional Ocaña, en concordancia con las políticas y normas generales de la misma.
El Subdirector Académico depende del Director de la Seccional y es después de este, la principal autoridad ejecutiva de la Seccional, según el orden de prelación que se contempla en la estructura orgánica de la UFPS. En orden de prelación está en primer lugar el Subdirector Académico.